엔비디아·워싱턴대, 단백질 설계 모델 'RFD4-Proteina' 공개

요약

NVIDIA와 워싱턴대학교 단백질 설계 연구소가 공동 개발한 BioNeMo 오픈 모델 'RFD4-Proteina'가 공개되었다. 이 모델은 기존 단백질 설계 워크플로우에서 단계별 모델을 분리해 사용하던 방식과 달리, 서열 및 전원자 구조 생성을 단일 모델로 통합하여 정보 손실을 최소화했다. 특히 단백질뿐만 아니라 소분자, 핵산, 당류, 금속 이온 등 다양한 분자 환경 내에서 단백질을 생성할 수 있는 것이 특징이다. RFD4-Proteina는 플로우 매칭 모델과 오토인코더를 결합하여 앵커 원자 좌표와 잠재 벡터를 생성하고, 이를 디코더를 통해 전원자 3D 구조와 서열로 확장한다. 이를 통해 연구자는 특정 표적 결합이나 촉매 모티프 등 구체적인 제약 조건을 바탕으로 정교한 단백질 설계가 가능하다.

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